科研 Skill 清单与下载安装教程

依据两期“10个科研 Skill”视频整理 适用环境：Codex Desktop / Codex CLI（Windows优先） 整理日期：2026年8月28日

一、10个科研 Skill 总览

先按任务阶段选工具，不建议一上来把10个skill同时交给AI。一个明确任务只指定一个主skill，必要时再把结果交给下一个。

推荐调用顺序

• 前期：academic-research-suite → nature-academic-search → nature-reader

• 写作：paper-spine 或 nature-writing → cite-verify → nature-polishing

• 投稿：nature-figure → nature-reviewer → nature-response

二、下载前准备

1. 先确认环境

• 已安装Codex Desktop或Codex CLI，并能正常新建对话。

• 安装Git；安装Nature Skills时还需要Node.js 18或更高版本。

• 能访问GitHub。校园网或公司网络受限时，应先解决合法网络访问问题。

• 不要对来源不明的skill直接执行安装脚本；先查看仓库、SKILL.md、脚本和许可证。

2. 安装位置与生效方式

全局skill目录：Windows通常位于 %USERPROFILE%.codex\skills\

生效方式：安装完成后关闭并重新打开Codex，或至少新建一个对话；旧对话可能仍使用旧skill缓存。

检查方式：在Codex中查看Skills列表，确认能搜到目标名称；随后用一条最小测试指令验证。

三、Nature Skills：7项一并安装

以下7项来自同一仓库：nature-reader、nature-writing、nature-academic-search、nature-polishing、nature-figure、nature-reviewer、nature-response。最省事的方式是安装该仓库的全部skill和共享支持包。

Windows PowerShell

npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --list

npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --global --agent codex --skill '*' --yes --copy

第一条命令只列出可安装项；第二条会全量安装，因此会包含本指南之外的其他Nature Skills。这样可以同时安装nature-shared，减少单独安装reader、writing、polishing时缺共享文件的问题。

只安装单项

npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --global --agent codex --skill nature-figure --yes --copy

把 nature-figure 替换为目标skill名即可。若单装 nature-reader、nature-writing 或 nature-polishing，请同时按仓库说明安装 nature-shared。

四、其余3项的安装方法

1. academic-research-suite

推荐使用Codex插件方式。

codex plugin marketplace add Imbad0202/academic-research-skills-codex --ref main

codex plugin add ars-codex@ars-codex

Codex Desktop用户也可以在Plugins中添加GitHub仓库，再安装 ars-codex。安装后新建对话，调用 academic-research-suite。

2. PaperSpine

Windows官方仓库提供PowerShell安装脚本。

git clone https://github.com/WUBING2023/PaperSpine.git

cd PaperSpine
.\install.ps1 -Target codex

安装后重启Codex，主入口名称为 paper-spine；还可以调用 paper-spine-research、paper-spine-citation、paper-spine-latex 等分支。

3. cite-verify

该项目官方首先面向Claude Code和macOS/Linux的Bash环境。Windows用户可先复制skill，再使用Git Bash或WSL运行其脚本。

npx skills add jonckr/cite-verify --global --agent codex --yes --copy

cd ~/.codex/skills/cite-verify
bash scripts/install_deps.sh

如果你的Windows环境没有bash、curl、jq等依赖，先不要强行运行；可改用WSL/Git Bash，或只在支持的环境中安装。

五、安装后的验证流程

• 重启Codex并新建一个对话。

• 在Skills列表中搜索准确名称；PaperSpine应搜索 paper-spine，而不是视频里的 paperspine。

• 先用不含敏感数据的小任务测试，例如让nature-reader读取一篇公开PDF。

• 若skill未触发，在提示词开头明确写“使用 skill名称”。

• 若提示缺少工具或依赖，按报错补齐，不要让AI换成完全不同的工具假装执行成功。

六、10个 Skill 的使用清单

01 academic-research-suite

Academic Research Suite

适用阶段：研究问题、综述与完整研究流程

核心用途：把选题澄清、检索规划、综述、论文结构、审稿模拟和修改流程串成一个有人确认节点的研究工作流。

建议输入：研究主题、目标期刊或课程要求、已有资料、截止时间。

常见输出：研究问题、检索方案、综述框架、证据清单、论文计划或审查报告。

示例提示词：使用 academic-research-suite，把“生成式AI在研究生教育中的使用”整理成一份可执行的系统综述方案。

注意事项：适合复杂任务，不等于自动完成研究；关键判断、纳排标准和最终结论仍需作者确认。

02 nature-reader

Nature Reader

适用阶段：PDF全文精读

核心用途：将论文PDF、DOI或网页整理为带原文锚点、图表位置和中英文对照的精读材料。

建议输入：PDF、DOI、arXiv链接、出版社网页或粘贴的全文。

常见输出：全文阅读稿、图表/公式说明、来源映射和术语备注。

示例提示词：使用 nature-reader 精读这篇PDF，保留英文原文、中文解释、图表位置和每段来源锚点。

注意事项：受版权或网页权限限制时，可能只能处理用户提供的合法全文或公开内容。

03 cite-verify

Cite-Verify

适用阶段：参考文献元数据核查

核心用途：通过Crossref等规范元数据核对DOI、题名、作者和年份，重点发现“真实标识符+虚假题名”式AI假引用。

建议输入：参考文献文本、Markdown、LaTeX或BibTeX文件。

常见输出：已核验、部分匹配、需人工核验、元数据不匹配等报告。

示例提示词：使用 cite-verify 检查这份参考文献，重点标出DOI、标题和作者不一致的条目。

注意事项：它核验的是元数据，不判断该文献是否真的支持论文中的某个观点；Windows运行脚本通常需要Git Bash或WSL。

04 nature-writing

Nature Writing

适用阶段：基于材料的论文起草

核心用途：根据作者提供的数据、图表、结果和笔记，搭建议论结构并起草摘要、引言、结果、讨论等章节。

建议输入：真实数据、确认过的结果、图表、研究笔记和目标体例。

常见输出：章节框架、论证顺序、待补证据标记和草稿。

示例提示词：使用 nature-writing，严格基于我提供的结果和图表，先搭建讨论部分框架，再起草正文。

注意事项：缺失的事实应标记为待补充，不能让模型补造实验结果或参考文献。

05 paper-spine

PaperSpine（视频中简称 paperspine）

适用阶段：论文主线与结构串联

核心用途：先学习目标场景和强论文，再确认研究动机，围绕证据链设计章节、论点和修改顺序。

建议输入：目标论文类型、参考强文、已有稿件、数据与作者确认的研究动机。

常见输出：研究档案、证据库、章节蓝图、修改矩阵和可追溯写作理由。

示例提示词：使用 paper-spine，先学习我提供的三篇目标期刊论文，再诊断当前稿件的主线和证据链。

注意事项：它是完整工作流入口，不只是润色器；新版本在Codex里以 paper-spine 及多个分支skill出现。

06 nature-academic-search

Nature Academic Search

适用阶段：多源检索与引用文件管理

核心用途：协调PubMed、Crossref、arXiv等来源完成检索、去重、引文核对以及NBIB/RIS/BibTeX转换。

建议输入：研究问题、关键词、时间范围、数据库偏好和纳排条件。

常见输出：检索式、候选文献、去重记录、引文文件和核查结果。

示例提示词：使用 nature-academic-search，为我的研究问题设计中英文检索式，并输出去重后的候选文献清单。

注意事项：Scopus、ScienceDirect等来源可能受机构权限、API或连接器配置影响。

07 nature-polishing

Nature Polishing

适用阶段：学术英语润色与重构

核心用途：对已有论文文本进行英文润色、翻译、段落重构和逻辑衔接，也覆盖部分LaTeX排版问题。

建议输入：作者已经完成的中文或英文草稿、目标期刊及不可改变的事实。

常见输出：润色稿、修改说明、逻辑风险和需作者确认的表达。

示例提示词：使用 nature-polishing 润色这段讨论，保留数据和结论边界，并逐条说明关键改动。

注意事项：不要把“润色”变成整段代写；对数值、因果关系和结论强度必须逐项核对。

08 nature-figure

Nature Figure

适用阶段：投稿级科研绘图

核心用途：用Python或R制作、审查和导出期刊级单图或多面板图，处理配色、版式、标注和导出规格。

建议输入：数据、图想表达的结论、目标期刊规格，以及Python或R的选择。

常见输出：绘图脚本、预览图、SVG/PDF/TIFF等投稿文件和图形QA结果。

示例提示词：使用 nature-figure，选择Python，把这组数据做成两面板投稿图，并导出SVG和600dpi TIFF。

注意事项：先选择Python或R；图形美化不能替代统计正确性，也不能掩盖异常值或不利结果。

09 nature-reviewer

Nature Reviewer

适用阶段：投稿前模拟审稿

核心用途：从审稿人视角检查创新性、意义、方法严谨性、证据链、结论边界和可复现性。

建议输入：尽可能完整的稿件、图表、补充材料和目标期刊。

常见输出：多位模拟审稿人报告、问题分级、共识风险和投稿前修改清单。

示例提示词：使用 nature-reviewer 模拟三位审稿人，分别检查创新性、实验设计和证据链，并给出综合风险排序。

注意事项：模拟审稿不能预测真实编辑决定；报告质量取决于你是否提供完整材料。

10 nature-response

Nature Response

适用阶段：审稿意见拆解与逐点回复

核心用途：将编辑决定信和审稿意见拆成逐点任务，辅助形成回复逻辑、修改清单和证据定位。

建议输入：决定信、审稿意见、原稿、修改稿及新增分析或实验结果。

常见输出：逐点回复框架、修改记录、证据位置和未解决风险。

示例提示词：使用 nature-response 拆解这份大修意见，生成逐点回复框架、对应修改位置和待补证据清单。

注意事项：不能虚构已完成的实验、分析或修改；每条回复必须能在稿件中找到对应证据。

七、最实用的组合流程

场景A：刚开始一个课题

• 用 academic-research-suite 明确研究问题、范围和综述计划。

• 用 nature-academic-search 设计检索式、收集并去重文献。

• 用 nature-reader 精读核心文献，形成可追溯笔记。

场景B：已有数据，准备写论文

• 用 paper-spine 先确认论文主线和证据链，或用 nature-writing 起草指定章节。

• 用 cite-verify 核对参考文献元数据。

• 用 nature-polishing 处理已经写好的中英文文本。

• 用 nature-figure 统一图形风格和投稿规格。

场景C：准备投稿或正在返修

• 用 nature-reviewer 做投稿前模拟审稿，按严重程度排序修改。

• 收到真实意见后，用 nature-response 拆解逐点回复和修改任务。

• 再回到 cite-verify 和 nature-figure 复核引用与图表。

八、常见问题

问：安装后为什么看不到？

答：重启Codex并新建对话；检查skill是否真的位于 .codex/skills 下且目录内直接存在 SKILL.md。

问：为什么skill被调用了却做不出结果？

答：Skill是流程说明，不会自动提供所有数据库权限、付费全文、Python/R包或外部连接器。根据报错补充环境。

问：可以一次让10个skill一起运行吗？

答：不建议。先选一个主任务和一个主skill，产出明确中间结果后再交给下一步。

问：能不能直接用于毕业论文？

答：可以用于方法学习、资料整理、结构诊断和合规辅助，但作者必须独立完成应由本人完成的研究与写作，并遵守学校、期刊和导师的AI使用政策。

问：如何更新？

答：先查看各官方仓库的更新说明。Nature Skills可重新运行安装命令；PaperSpine提供 paper-spine-update；其他项目按其README执行。更新后重新开对话。

九、官方来源与核对链接

• Nature Skills：https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills

• Academic Research Skills for Codex：https://github.com/Imbad0202/academic-research-skills-codex

• PaperSpine：https://github.com/WUBING2023/PaperSpine

• cite-verify：https://github.com/jonckr/cite-verify

• OpenAI Codex skill installer sample：https://github.com/openai/codex/tree/main/codex-rs/skills/src/assets/samples/skill-installer

安装命令和仓库结构可能更新。正式发送给客户前，建议再次打开上述官方仓库核对最新README。

本资料用于科研工具教学与学术规范辅导，不提供论文代写，不编造数据，不承诺期刊录用。